Jurusan Kimia menjalin kerjasama dengan Instansi/ industri antara lain:
- Austrian-Indonesian Centre for Computational Chemistry (AIC)
- Indonesia Science Toray Foundation (Tohoku University)
- Universiti Teknologi Malaysia (UTM)
- Universitas Sebelas Maret
- Konsorsium Jurusan Kimia Se Jawa Tengah
- ITB
- UGM
- BATAN
- LIPI
- LEMIGAS
- INDESSO AROMA
- PT Holcim Indonesia Tbk., Cilacap
- PT Monokem Surya